迅速、シンプルな自動化エンドツーエンドの次世代シーケンス(NGS)ワークフローにより、結果を最短24時間で取得

Ion Torrent Genexusシステムは、次世代シーケンシング(NGS)プラットフォームである2つの装置を使用することにより、NGSワークフローの主要なステップであるサンプル精製と定量、ライブラリ調製、シーケンシング、バイオインフォマティクス解析、レポート作成などを自動化することができます。

 

Genexus PutrificationPurificationシステムGenexus IntegratedIntegratedシーケンサはGenexusソフトウェアを介してシームレスに連携し、サンプル情報と解析結果のトラッキングプロセスを通じて自動的に実施します。自動化システムにより、わずかなマニュアルのステップで、高品質なデータの取得と迅速なレポート作成が容易になり、施設でのNGS解析が身近になりますが、NGS解析のための専用スタッフや専門的なトレーニングの必要はありません。


Genexusシステムを用いたインハウスのNGS解析について

NGS解析を自施設でご利用いただけます

Genexusシステムでは、NGSのワークフローがウォークアウェイオートメーションにより迅速かつ簡単化されるため、NGS解析が初めての方でも、インハウスのNGS解析を実施いただけます。NGSワークフローのこうした進歩は、オペレーション効率を新たなレベルに高め、NGS検査のハンズオンタイムを削減し、専門スタッフを増員する必要がありません。そのため、貴重な時間を他の優先事項を実施いただくことができ、ご施設で実施する検査をスケールアップすることができます。

 

GenexusシステムはNGSアッセイの再現性も向上させるだけでなく、当社システムを複合的にご利用いただくことにより、サービスとサポートのオプションを組み合わせられます。そのため、長期的なコスト削減にもつながります。 

Genexusシステムの機能とは?

Genexusシステムは2つの装置の統合型システムであり、これらを単一のソフトウェアでリンクすることで、サンプルインプット、実験プランのセットアップ、データ解析、レポート作成をトータルで行えます。

 

このように自動化されたNGSワークフローの最初のステップでは、GenexusPurificationシステムによって核酸を迅速に抽出して定量します。この過程はハンズフリーのウォークアウェイオートメーションにより処理されるため、サンプル調製でマニュアルのピペット操作は不要になります。次にGenexus Integratedシーケンサにより、ライブラリ調製、テンプレート化、シーケンシング、データ解析、レポート作成を自動的に処理します。Genexus PurificationシステムおよびGenexus Integratedシステムは統合的なシステムのため、製品間で連携ができるよう最適化されています。そのため、トータル自動NGSワークフローを実施いただけます。


Genexusシステムの装置について

Genexus Purificationシステム

GenexusPurificationシステムは、核酸の抽出、精製、定量が自動化され、一貫性した、効率性の高い次世代シーケンシング(NGS)用のサンプル調製が可能です。シンプルなワークフローとわずかなハンズオンタイムにより、サンプルのNGS対応プレート調整までの過程をわずか数分で完了し、Genexus Integratedシーケンサにロードする準備が整います。
 

Genexus Integratedシーケンサ

Genexus Integratedシーケンサにより、NGSのライブラリ調製、シーケンシング、分析が自動化されます。Genexus IntegratedシーケンサとGenexus Purificationシステムの2つの装置、ならびにソフトウェアの統合システムにより、マニュアル操作を最小限に抑えることができます。Genexusシステムをご使用いただくことにより、自動化されたワークフロー、データ分析とレポート作成、シーケンスのパフォーマンスを活用いただくことができます。そのため、シーケンスやバイオインフォマティクスに関する専門知識を必要とすることなく、あらゆるご施設でNGS解析を実施いただけます。


Genexusシステムワークフローの詳細について

自動化されたGenexusシステムのワークフローでは、ハンズオンタイムが最小化され、NGS解析の結果を迅速かつシンプルに得ることができます。そのためご施設でのインハウスのNGSアッセイでは、短いターンアラウンドタイムで結果を得ることができます。その際、NGSが初めての方でも、広範なトレーニングは必要ありません。

 

マニュアル操作を必要とするタッチポイントはわずか2回です。1回目はGenexus Purificationシステムで行うサンプル精製用のセットアップ、2回目はGenexus Integratedシーケンサで行うライブラリ調製、シーケンシング、解析、レポート作成の自動処理用のセットアップです。全てのワークフローを通じたハンズオンタイムは合計20分のみであり、PCRやIHCなどのアッセイと同程度の利便性でご利用いただけます。

Figure 1: The Genexus System is two instruments connected by one software.

Genexusシステムは、臨床研究者やテクニシャンがNGS解析を完了させるために使用されています。当社のIon AmpliSeqアッセイは感度が高く、ご施設での運用に貢献します。Ion AmpliSeqアッセイではプライマープールを付属しており、多くのアッセイにはバイオインフォマティクスツールとレポート機能が備わっています。

腫瘍学研究ソリューション

Genexusシステムで使用可能なOncomineソリューションは、サンプルからレポート作成までのトータルなNGSワークフローを提供します。ワークフロー完了までの時間はIHCやその他の手法と同程度であり、詳細なゲノムプロファイリングを得ることができます。Genexusシステムでは、複数のがん種に見られる主要なバイオマーカー探索に、複数のOncomineアッセイを利用いただけます。

さまざまな臨床研究アプリケーションに適したOncomineアッセイ:

  • ゲノムプロファイリング
  • リキッドバイオプシー
  • 血液学的悪性腫瘍
  • がん免疫学

遺伝性疾患の研究ソリューション

遺伝性疾患の研究では、既存の方法やパネルでは解析できない場合があります。Ion AmpliSeq On-Demandパネルを使用すると、遺伝性がん、原発性免疫不全症、難聴、筋ジストロフィーなどの遺伝性疾患の研究に関連する5,000以上の遺伝子(事前テスト済み)からカスタムパネルを作成できます。そのため、NGS解析のご施設での利用が簡素化できます。

 

 

 

 

感染症研究ソリューション

Ion Torrent NGSテクノロジーは、ウルトラハイマルチプレックスPCRテクノロジーに基づいており、公衆衛生機関などがウイルス感染の動向を監視するのに役立ちますこのパネルには、SARS-CoV-2ウイルスのゲノムシーケンシングとバリアント同定のアッセイが含まれます。

独自のパネルをデザインする場合

Ion AmpliSeq Designerにより、シンプルなプロセスでカスタムアッセイをデザインいただけます。このWebツールは、ご希望のカスタムプライマーパネルを作成にご利用いただけます。


ステップ1:パネル名を付け、必要な識別情報を追加
ステップ2:アプリケーションタイプを選択
ステップ3:DNAタイプを選択

既存の設計済みパネルを参照や、独自のカスタムソリューションを設計するには、ampliseq.comにアクセスしてください。

機器分析の検証およびメンテナンスサービス

ご施設の実験室での実践的なトレーニングに加えて、オンサイトサービスプラン、リモートサポートオプションおよび、製品を最大限に活用するためのコンサルティングサービスもご利用いただけます。

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.