流式细胞术检测RNA靶标
PrimeFlow™ RNA浓度定量测定采用新型RNA原位杂交技术,结合了bDNA专利技术,实现了利用流式细胞术进行RNA测定的表达。使用4种不同荧光染料的标记探针进行胞内的RNA原位杂交,同时兼容表面蛋白抗体染色,研究人员现可在单细胞解析度下,同时进行RNA测定及蛋白表达。
PrimeFlow RNA检测原理
- 基因特异性寡核苷酸靶标探针组结合靶标RNA序列
- 信号预放大探针和多个放大探针分子先后与靶标RNA结合,进行信号扩增
- 结合上荧光染料的标记探针,通过流式细胞仪可以检测到多达4种RNA靶标。
订购信息
遵照如下五个步骤开始您的PrimeFlow RNA浓度定量测定
仪器 | 规格 |
---|---|
流式细胞仪 | 激光:
滤光片组:
|
培养箱 | Capable of maintaining temperature at 40 ±1°C |
金属热模块 | 适用于1.5 mL微离心管,放在温度经验证的培养箱内 |
温度验证仪 | InvitrogenViewRNA温度验证仪采用经过校准的温度计确认培养箱温度 |
可选:您的靶标是microRNA? 此缓冲液可助您确保获得更高的miRNA信号及灵敏度。
可选:此检测采用96孔板进行实验?
- 目前有四种类型的探针组可用于RNA测定
- 根据RNA表达水平选择不同的探针类型
- 对细胞表面和细胞内蛋白进行免疫多色分析时,可查找结合荧光染料的抗体
靶标RNA表达水平 | 荧光标记 | 激光激发波长 (nm) | 带通滤波器 (nm) | 荧光通道 | 探针集类型 |
---|---|---|---|---|---|
低 | Alexa Fluor 647 | 633, 635 | 660/20 | APC, Alexa Fluor 647, eFluor 660 | Type 1 |
Low | Alexa Fluor 568 | 561 | 610/20 | PE-eFluor 610, Alexa Fluor 568, PE-Texas Red | Type 10 |
Medium-to-high | Alexa Fluor 488 | 488 | 530/30 | FITC, Alexa Fluor 488 | Type 4 |
Medium-to-high | Alexa Fluor 750 | 633, 635 | 780/60 | APC-Cy7, APC-eFluor 780, Alexa Fluor 750 | Type 6 |
- 阳性对照—每次实验均使用阳性对照探针,确保正常的实验性能:RPL13a(用于人类白细胞)和β-激动蛋白 (ACTB)(用于小鼠组织);对于特殊细胞类型和其他建议的基因,请参阅PrimeFlow RNA检测试剂盒产品手册附录 5
- 阴性对照—如无靶标特异性探针的样品,采用靶向目标细胞不表达的靶标的探针标记的样品(例如,细菌基因dapB);高度推荐采用
采用第4步中的探针搜索工具,搜索用于阳性和阴性对照的探针。
你需要SARS-CoV-2探针吗?
使用上面的分步订购信息来订购您的试剂盒和探针,包括对照品。在第4步中,如果您需要SARS-CoV-2探针,请参见下表,并按照所提供的“如何订购SARS-CoV-2探针”说明进行操作。
Dye | Type | Scale | Cat. No. | Assay ID |
---|---|---|---|---|
AF647 | 1 | 40 assays | CPF-204 | VPNKRHH |
AF647 | 1 | 100 assays | CPF-210 | VPNKRHH |
AF488 | 4 | 40 assays | CPF-204 | VP9HHYZ |
AF488 | 4 | 100 assays | CPF-210 | VP9HHYZ |
AF750 | 6 | 40 assays | CPF-204 | VPAAADR |
AF750 | 6 | 100 assays | CPF-210 | VPAAADR |
AF568 | 10 | 40 assays | CPF-204 | VPCE3XN |
AF568 | 10 | 100 assays | CPF-210 | VPCE3XN |
PrimeFlow探针组是使用NCBI菌株和登录号LC521925的序列设计的,涵盖了病毒转录本的多个区域。在下面的表格中找到检测中包含的探针组的结合点和转录本区域。如果你需要为特定的RNA区域设计一个定制探针,请使用定制分支DNA探针组工具。
Position (5' to 3') | Region | |
---|---|---|
1 | 705-1676 | orf1ab |
2 | 4356-5607 | orf1ab |
3 | 12808-13942 | orf1ab |
4 | 20571-21759 | orf1ab |
5 | 26646-27763 | M |
6 | 28212-29152 | ORF8 and N |
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不可转售。Super Bright聚合物染料由Becton, Dickinson and Company授权销售。
仅供科研使用,不可用于诊断目的。