该试剂盒将 SuperScript IV 反转录酶和 Platinum SuperFi 高保真酶相结合,再加上链置换技术,可实现全长 cDNA 扩增,并且得率高、灵敏度和准确性出众,适用于下游 NGS 或 qPCR 分析。
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直接反转录:从细胞到 cDNA
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直接反转录试剂盒旨在直接从细胞裂解物中合成 cDNA,而无需提取 RNA。细胞裂解和反转录在同一反应管中进行。合成的第一链 cDNA 可直接用于 PCR 和 qPCR 等下游实验应用。Cells-to-cDNA 试剂盒包括:
该试剂盒将 SuperScript IV 反转录酶和 Platinum SuperFi 高保真酶相结合,再加上链置换技术,可实现全长 cDNA 扩增,并且得率高、灵敏度和准确性出众,适用于下游 NGS 或 qPCR 分析。
SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒旨在直接从哺乳动物细胞裂解物中合成第一链 cDNA,试剂盒中提供用于细胞裂解和反转录的试剂。
该试剂盒中提供含有 SuperScript IV 反转录酶预混合组分。简化的 cDNA 合成流程让您无需提取 RNA。
实验数据证明,SuperScript IV 单细胞/低起始量 cDNA 预扩增试剂盒可从低起始量 RNA 或单细胞中获得高得率的 cDNA。低起始量 (2 pg) 通用人类参考 RNA (UHRR) 的 cDNA 得率几乎是 NEBNext™ Single Cell/Low Input cDNA Synthesis and Amplification Module 得率的两倍(图1)。
与 Smart-seq3 实验方案 V.3 实验流程和 NEBNext™ 试剂盒实验流程相比,SuperScript IV 单细胞/低起始量 cDNA 预扩增试剂盒实验流程所需的时间明显更短(图2)。
图 2.与同类产品实验流程的比较。SuperScript IV 单细胞/低起始量 cDNA 预扩增试剂盒与 Smart-seq3 实验方案 V.3 和 NEBNext™ 试剂盒的实验流程和所需时间比较。
实验数据证明,SuperScript IV 单细胞/低起始量 cDNA 预扩增试剂盒可从低起始量 RNA 或单细胞中获得高得率的 cDNA。低起始量 (2 pg) 通用人类参考 RNA (UHRR) 的 cDNA 得率几乎是 NEBNext™ Single Cell/Low Input cDNA Synthesis and Amplification Module 得率的两倍(图1)。
与 Smart-seq3 实验方案 V.3 实验流程和 NEBNext™ 试剂盒实验流程相比,SuperScript IV 单细胞/低起始量 cDNA 预扩增试剂盒实验流程所需的时间明显更短(图2)。
图 2.与同类产品实验流程的比较。SuperScript IV 单细胞/低起始量 cDNA 预扩增试剂盒与 Smart-seq3 实验方案 V.3 和 NEBNext™ 试剂盒的实验流程和所需时间比较。
SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒使用简化的 cDNA 合成流程,无需提取 RNA(图3)。使用该方法,所需的移液步骤更少,这有助于防止 RNA 损失和污染,从而节省时间和精力。
图 3.与传统方法实验流程的比较。相较于传统的 cDNA 合成方法,SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒所用的实验方案可将从细胞到 cDNA 所需的时间缩短一半以上,节省时间的关键步骤与 RNA 分离纯化有关。
SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒的性能优于其它厂商的同类试剂盒。在 HeLa S3 细胞研究中,针对不同细胞数量和样本大小,该试剂盒均可进行灵敏检测;对于高丰度 (ACTB)、中等丰度 (PGK1) 和低丰度 (BCL2) 转录本,均能获得更高得率。
使用 SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒从 ACTB(高丰度转录本)合成 cDNA,使用靶标特异性引物。图 4A 和 4B 显示,与同类试剂盒相比,SuperScript IV CellsDirect试剂盒具有更为出色的灵敏度和得率。
图4.使用不同 cDNA 合成试剂盒,从 ACTB(高丰度转录本)中合成 cDNA 的结果比较。(A) 使用 SYBR Green Assay 分析 ACTB 的 cDNA 合成:使用一系列不同稀释度的 HeLa S3 细胞代表一系列不同样本,每个样本含 10 -10,000 个细胞,按照制造商提供的使用说明裂解细胞并合成 cDNA。使用 PowerTrack SYBR Green Master Mix进行 qPCR 分析。(B) 条形图显示了 Ct 值的对比差异(代表得率差异)。与同类产品相比,SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒能稳定提供较高的 cDNA 得率。
使用 SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒从 PGK1(中等丰度基因靶标)合成 cDNA,使用靶标特异性引物。图 5A 和 5B 显示,对HeLa S3 细胞的一系列 10 不同稀释度样本(10-10,000 个细胞)进行检测时,相比同类试剂盒,SuperScript IV CellsDirect可提供出色的灵敏度和产量。
图 5.使用不同 cDNA 合成试剂盒,从 PGK1(中等丰度转录本)合成 cDNA 的结果比较。 (A) 使用 TaqMan Assay 分析j检测 PGK1 的 cDNA 合成和扩增曲线:使用一系列不同稀释度的 HeLa S3 细胞代表不同样本(每个样本含 10 -10,000 个细胞),按照制造商提供的使用说明裂解细胞并合成 cDNA。使用 TaqMan Fast Advanced Master Mix进行分析。(B) 条形图显示针对中等丰度转录本 PGK1 时的灵敏度和得率。SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒的性能出众。
使用 SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒从 BCL2(低丰度靶标)合成 cDNA,使用靶标特异性引物。图 6A 和 6B 显示,对 HeLa S3 细胞的一系列 10 不同稀释度样本(10-10,000 个细胞)进行检测时,相比同类试剂盒,SuperScript IV CellsDirect可提供出色的灵敏度和得率。
图6.使用不同 cDNA 合成试剂盒,从 BCL2(低丰度转录本)合成 cDNA 的结果比较。(A) 使用 SYBR Green Assay 分析检测 BCL2 的 cDNA 合成:使用一系列不同稀释度的 HeLa S3 细胞代表不同样本(每个样本含 10 -10,000 个细胞),按照制造商提供的使用说明,裂解细胞并合成 cDNA。使用 PowerTrack SYBR Green Master Mix 进行分析检测。(B)条形图显示针对处理低丰度转录本 BCL2 时的灵敏度和得率。SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒的性能出众。
使用 SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒从 ACTB(高丰度转录本)合成 cDNA,使用靶标特异性引物。图 4A 和 4B 显示,与同类试剂盒相比,SuperScript IV CellsDirect试剂盒具有更为出色的灵敏度和得率。
图4.使用不同 cDNA 合成试剂盒,从 ACTB(高丰度转录本)中合成 cDNA 的结果比较。(A) 使用 SYBR Green Assay 分析 ACTB 的 cDNA 合成:使用一系列不同稀释度的 HeLa S3 细胞代表一系列不同样本,每个样本含 10 -10,000 个细胞,按照制造商提供的使用说明裂解细胞并合成 cDNA。使用 PowerTrack SYBR Green Master Mix进行 qPCR 分析。(B) 条形图显示了 Ct 值的对比差异(代表得率差异)。与同类产品相比,SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒能稳定提供较高的 cDNA 得率。
使用 SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒从 PGK1(中等丰度基因靶标)合成 cDNA,使用靶标特异性引物。图 5A 和 5B 显示,对HeLa S3 细胞的一系列 10 不同稀释度样本(10-10,000 个细胞)进行检测时,相比同类试剂盒,SuperScript IV CellsDirect可提供出色的灵敏度和产量。
图 5.使用不同 cDNA 合成试剂盒,从 PGK1(中等丰度转录本)合成 cDNA 的结果比较。 (A) 使用 TaqMan Assay 分析j检测 PGK1 的 cDNA 合成和扩增曲线:使用一系列不同稀释度的 HeLa S3 细胞代表不同样本(每个样本含 10 -10,000 个细胞),按照制造商提供的使用说明裂解细胞并合成 cDNA。使用 TaqMan Fast Advanced Master Mix进行分析。(B) 条形图显示针对中等丰度转录本 PGK1 时的灵敏度和得率。SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒的性能出众。
使用 SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒从 BCL2(低丰度靶标)合成 cDNA,使用靶标特异性引物。图 6A 和 6B 显示,对 HeLa S3 细胞的一系列 10 不同稀释度样本(10-10,000 个细胞)进行检测时,相比同类试剂盒,SuperScript IV CellsDirect可提供出色的灵敏度和得率。
图6.使用不同 cDNA 合成试剂盒,从 BCL2(低丰度转录本)合成 cDNA 的结果比较。(A) 使用 SYBR Green Assay 分析检测 BCL2 的 cDNA 合成:使用一系列不同稀释度的 HeLa S3 细胞代表不同样本(每个样本含 10 -10,000 个细胞),按照制造商提供的使用说明,裂解细胞并合成 cDNA。使用 PowerTrack SYBR Green Master Mix 进行分析检测。(B)条形图显示针对处理低丰度转录本 BCL2 时的灵敏度和得率。SuperScript IV CellsDirect cDNA 合成试剂盒的性能出众。
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