showcase.par.45838.image.200.150.1.aflp

AFLP® は、ゲノム情報のない DNA 多型を検出する技術です。 制限酵素による DNA の消化後、DNA フラグメントのサブセットを選択し、PCR 増幅して視覚化します。 その後、特定のゲノムに固有のフィンガープリントを作成します。 当初は植物研究用に開発された AFLP® は、現在さまざまな遺伝子解析アプリケーションに使用されています。

図1 P1、P2、F1 サンプルの AFLP® アッセイ データの解析 左のグラフには、3 つのサンプルの AFLP® のピーク(青)とサイズ スタンダードのピーク(赤)が見られます。 右のグラフにはビン(グレーのバー)とアレル コールが表示されています。

AFLP® 解析の特長は、いかなる生物種でも配列データを必要とせず、迅速に大量のマーカー フラグメントを作成できる高速性です。

AFLP® 解析の手順

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。

推奨製品: DNA単離法

AFLP 解析

ゲノム DNA を制限酵素 Msel と EcoRI でフラグメントに切断し、アダプタをライゲーションします。

推奨製品: 制限酵素による消化とライゲーション

お客様に最適な製品をお選びください。

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識 サイズ スタンダードを標識する蛍光色素 推奨サイズ スタンダード 使用可能なアプリケーション その他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
病原菌検出
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適な電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)とは?

  機器
 3730xl
3730xL
3730
3730
3500xl
3500xL
3500
3500
3130xl
3130xL
3130
3130
310
310
キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
フラグメント長の多型
- AFLPSSSSSSS
- RFLPAAAAAAA

AFLP プロファイルを解析します。

 

推奨製品: データ分析

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。

推奨製品: DNA単離法

AFLP 解析

ゲノム DNA を制限酵素 Msel と EcoRI でフラグメントに切断し、アダプタをライゲーションします。

推奨製品: 制限酵素による消化とライゲーション

お客様に最適な製品をお選びください。

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識 サイズ スタンダードを標識する蛍光色素 推奨サイズ スタンダード 使用可能なアプリケーション その他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
病原菌検出
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適な電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)とは?

  機器
 3730xl
3730xL
3730
3730
3500xl
3500xL
3500
3500
3130xl
3130xL
3130
3130
310
310
キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
フラグメント長の多型
- AFLPSSSSSSS
- RFLPAAAAAAA

AFLP プロファイルを解析します。

 

推奨製品: データ分析

AFLP® 解析の手順

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。

推奨製品: DNA単離法

AFLP 解析

ゲノム DNA を制限酵素 Msel と EcoRI でフラグメントに切断し、アダプタをライゲーションします。

推奨製品: 制限酵素による消化とライゲーション

お客様に最適な製品をお選びください。

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識 サイズ スタンダードを標識する蛍光色素 推奨サイズ スタンダード 使用可能なアプリケーション その他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
病原菌検出
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適な電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)とは?

  機器
 3730xl
3730xL
3730
3730
3500xl
3500xL
3500
3500
3130xl
3130xL
3130
3130
310
310
キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
フラグメント長の多型
- AFLPSSSSSSS
- RFLPAAAAAAA

AFLP プロファイルを解析します。

 

推奨製品: データ分析

DNA 精製キット

DNA の抽出は、DNA シーケンシングとフラグメント解析の実験ワークフローにおける重要な第一ステップです。 DNA の配列解析における全体的な読み取りの品質と精度、長さは、サンプル自体の特性と核酸抽出法に大きく左右される可能性があります。 最適な抽出法は、サンプル源や組織の種類、サンプルの入手方法、抽出前の取り扱いもしくは保存方法によって異なります。

推奨製品: DNA単離法

AFLP 解析

ゲノム DNA を制限酵素 Msel と EcoRI でフラグメントに切断し、アダプタをライゲーションします。

推奨製品: 制限酵素による消化とライゲーション

お客様に最適な製品をお選びください。

フラグメント解析のサイジング グラフ画像

PCR 産物のサンプルをサイズ スタンダードと Hi-Di Formamide の混合液に加え、熱変性して電気泳動します。

推奨製品: 解析サンプルの調製

サイズ情報

サイジング実験に使用する GeneScan サイズ スタンダードの詳細については、次の表をご覧ください。

DNA フラグメントの標識 サイズ スタンダードを標識する蛍光色素 推奨サイズ スタンダード 使用可能なアプリケーション その他のキットと製品
dR110、dR6G、dTAMRA™、dROX(Dye Set DS-02 - Filter E5)LIZ®
SNaPshot®
マイクロサテライト、LOH、キメリズム、ISSR、RFLP、T-RFLP、MSMSA
5-FAM™、HEX™、NED™(Dye Set DS-30 - Filter D)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standardカスタム フラグメント解析カスタム プライマー
6-FAM™、VIC®、NED™(Dye Set DS-31 - Filter D**)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard

カスタム フラグメント解析

カスタム プライマー
5-FAM™、JOE、NED™(Dye Set DS-32 - Filter F)ROX™GeneScan™ 500 ROX™ Size Standard
マイクロサテライト(法医学)
AFLP
6-FAM™、VIC®、NED™、PET®(Dye Set DS-33 - Filter G5)LIZ®GeneScan™ 600 LIZ Size Standard v2.0
マイクロサテライト(法医学)
病原菌検出
カスタム フラグメント解析
キャピラリ電気泳動

キャピラリ電気泳動の際、PCR 産物はポリマーを充填したキャピラリに電気的にインジェクションされます。 蛍光標識した DNA フラグメントに高い電圧をかけてサイズ別に分離し、レーザーとカメラのシステムで検出します。

お客様に最適な電気泳動装置(ジェネティック アナライザ)とは?

  機器
 3730xl
3730xL
3730
3730
3500xl
3500xL
3500
3500
3130xl
3130xL
3130
3130
310
310
キャピラリ本数96482481641
互換性のあるアプリケーション:
(S) サポート済み、(A) AB が証明済み、(C) お客様が証明済み、(N) サポートなし
フラグメント長の多型
- AFLPSSSSSSS
- RFLPAAAAAAA

AFLP プロファイルを解析します。

 

推奨製品: データ分析

ISSR 解析用の推奨製品

GeneMapper® ソフトウェア

AFLP 解析システム

情報:

北米開催のトレーニング コース

欧州開催のトレーニング コース

フォーラム&コミュニティ

最新情報

次世代テクノロジー

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.