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組織および細胞からのRNA抽出 |
組織や細胞からのRNA抽出は、細胞を溶解して全核酸を遊離するプロセスから始まります。サーモフィッシャーサイエンティフィックのRNA抽出試薬とキットは、培養細胞や組織サンプルから始める場合でも、植物、細菌、哺乳類細胞から始める場合でも、お客様の研究に最適な製品を提供します。サーモフィッシャーサイエンティフィックには、信頼性の高いTRIzol試薬やPureLink精製キットなどの従来のInvitrogen製品のほか、Cells-to-CT、MagMAX、RNAlater kitおよび試薬などの優れた製品があります。
RNAlater溶液は、インタクトの動物組織、器官、細胞、および細菌中のRNAの保存に広く使用されています。RNAを単離するためにサンプルを直ちに処理したり、後で処理するために液体窒素で凍結したりする必要がありません。
組織サンプルからRNAを抽出するには、特定の組織からRNA分子を分離および精製します。この方法では組織サンプルを回収する必要があり、生検や外科的処置などのさまざまな手法で入手できます。次に、組織をホモジナイズして、細胞を破壊し、RNAを放出します。抽出されたRNAには、組織内に存在するさまざまな細胞タイプの混合物が含まれている場合があり、RNA組成にばらつきが生じる可能性があります。したがって、組織サンプルのタイプとサイズを慎重に選択し、目的の細胞集団を確実に表すことが重要です。
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高純度でインタクトなRNAのゴールドスタンダード | シンプルで信頼性の高い迅速なメソッド | 96サンプル用の高速で便利なカラムベースのフィルタープレートフォーマット(RNA >200 nt) | 限られたサンプル量から迅速で便利なカラムベースのメソッド(RNA >200 nt) | 小型RNA種の迅速で便利な方法 | 最高純度のTRIzol+カラム精製で、沈殿は不要です | HTPフォーマットで、あらゆるサイズのRNA(microRNAを含む)を回収できます | |
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TRIzol Reagent | PureLink RNA Miniキット | PureLink Pro 96トータルRNA精製キット | PureLink RNAマイクロスケールキット | mirVana miRNA Isolation Kit | TRIzol Plus RNA Purification System | MagMAX mirVana Total RNA Isolation | |
Top seller | ✓ | ||||||
分離方法 | 高純度有機抽出(アルコール沈殿が必要) | 迅速簡便なシリカカラム | 迅速フィルタープレートフォーマットの便利なシリカカラム | 迅速で便利なマイクロシリカカラム | 有機抽出と便利なシリカカラムの組み合わせ | 最高の純度と利便性。有機抽出とシリカカラムの両方を含みます(沈殿不要) | 大容量化可能でフレキシブルな磁気ビーズ法 |
調製時間 | 1時間 | 20分 | 20分 | 20分 | 30分 | 1時間 | <1時間 |
開始物質の量 | 最大100 mg | 10 mg~100 mg | 10細胞~10 mg | 最大10 mg | 最大250 mgの組織 | 最大100 mg | 最大50 mg |
ハイスループット対応 | ✓ | ✓ | |||||
調製サイズ | 100回分 | 50回分 | 96回分 | 50回分 | 96回分 | 50回分 | 96回分 |
注:このプロトコルでは、TRIzolまたは同様の試薬を使用した組織からのRNA抽出プロセスの基本的な概要を提供します。詳細なガイドラインと安全上の注意事項については、試薬に付属の具体的な説明書を参照することが重要です。
細胞からのRNA抽出は、培養細胞または細胞懸濁液から特異的にRNAを単離するプロセスです。この方法には、酵素的に細胞膜を分解して、RNAなどの細胞内容物を放出することが含まれます。組織サンプルとは異なり、細胞培養ではより均質な細胞集団が得られるため、その集団内の遺伝子発現をより特異的に分析できます。さらに、細胞培養は制御された条件下で操作および処理できるため、さまざまな実験介入がRNA発現に与える影響を研究しやすくなります。
最初にRNAを単離することなく、培養細胞ライセートを分析することもできます。qPCRの結果は、精製したRNAと同等または場合によってはそれ以上の結果を得ることができます。Cells-to-CTおよびSingle Cell-to-CT製品ラインなどのInvitrogen製品は、優れた性能と取り扱いの利点を提供します。
はい、RNAは細胞から抽出できます。このプロセスは、通常、培養細胞は均一な細胞集団であり、組織はより不均一であり、多くの細胞集団と細胞外マトリックスを含んでいるため、組織サンプルからRNAを抽出すると比較してわずかに異なります。
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高純度で完全なRNA | RNA>(200 nt)用の高速で便利なカラムベースのフォーマット | 96サンプル用の高速で便利なカラムベースのフィルタープレートフォーマット(RNA >200 nt) | 限られたサンプル量から迅速で便利なカラムベースのメソッド(RNA >200 nt) | スモールRNA種の迅速で便利な方法 | RNA精製なしでqRT-PCRへの細胞用の完全なシステム | |
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TRIzol Reagent | PureLink RNA Miniキット | PureLink Pro 96トータルRNA精製キット | PureLink RNAマイクロスケールキット | MirVana miRNA Isolation Kit | Cells-to-CTキット | |
Top seller | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ||
調製時間 | 1時間 | 20分 | 20分 | 20分 | 30分 | <10分 |
細胞溶解法 | 高純度有機抽出(アルコール沈殿が必要) | 無毒性グアニジンイソチオシアン酸塩の溶解 | 無毒性グアニジンイソチオシアン酸塩の溶解 | 無毒性グアニジンイソチオシアン酸塩の溶解 | 有機抽出の後にアルコール沈殿 | Cells-to-CT溶解 |
開始物質の量 | 最高1x107細胞 | 5x106~1x108細胞 | 5x106~1x108細胞 | 最高1x105細胞 | 102~107培養細胞 | 10~100,000細胞 |
アプリケーション | すべてのRNA発現法 | qRT-PCR、NGS | qRT-PCR、NGS | qRT-PCR、NGS | Micro RNA解析 | qRT-PCR |
ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルからRNAを抽出することは、分子生物学研究において重要な技術です。FFPEサンプルは貴重なアーカイブ組織標本を提供するため、臨床および病理学的研究で一般的に使用されます。しかし、FFPEサンプルの保存プロセスはRNAの著しい分解やクロスリンクを引き起こす可能性があるため、抽出プロセスを困難にしています。
FFPEサンプルからRNAを抽出する方法には、いくつかの重要なステップがあります。
FFPEサンプル中のRNAの分解やクロスリンクが発生する可能性があるため、抽出されたRNAは最高品質ではない場合があります。そのため、RNAの完全性を慎重に評価し、RT-qPCRやRNAシーケンシングなどの分解RNA用に特別に設計された方法の使用を検討することが不可欠です。
FFPE組織から単離されたRNAの全体的な品質と収量に影響を与える可能性のあるいくつかの要因があります。FFPEサンプルを扱う際の推奨事項をまとめたものです。
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同じFFPE切片からRNAとDNAを低スループットで単離します | 同じFFPE切片からRNAとDNAを拡張可能に単離 | |
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RecoverAll Total Nucleic Acid Isolation Kit for FFPE | MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra Kit | |
調製時間 | 4.5時間(16サンプルの総時間) 操作時間2.5時間 | 4時間(96回分の調製にかかる合計時間) 操作時間1時間 |
Final product extracted | トータルRNA、microRNA、gDNA | トータルRNA、microRNA、gDNA |
分離方法 | カラム精製 | 磁気ビーズ精製 |
脱パラフィンが必要です | ✓ | ✓ |
自動化対応(脱パラフィン後) | ✓ (KingFisher FlexおよびDuo Primeのスクリプト) | |
適合するFFPEサンプル範囲 | 最大4 x 20ミクロンの切片 (300 mm2組織) | 最大2 x 20ミクロンの切片 (300 mm2組織) |
サンプル量 | 約50 µLの精製DNA 約50 µLの精製RNA | 約50 µLの精製DNA 約50 µLの精製RNA |
Ion AmpliSeq DNAパネル(例:Cancer Hotspot Panel v2)と互換性があります | ✓ | ✓ |
Ion AmpliSeq RNAパネル(RNAがんやRNA融合など)と互換性があります | ✓ | ✓ |
植物RNAの抽出には、細胞壁を破壊するための組織のホモジナイゼーション、細胞成分を可溶化するための抽出試薬による処理、汚染物質の除去、抽出RNAの精製など、いくつかの重要なステップが含まれます。植物サンプルからRNAを抽出する方法では、硬質の細胞壁が存在し、二次代謝物が高レベルであるために、特有の課題があります。
植物RNAの単離における大きな問題の1つは、ポリフェノール化合物や多糖類などの生体分子の存在です。Invitrogen Plant RNA Isolation Aidは、ポリフェノールや多糖類と結合する高分子量ポリマーであるポリビニルピロリドンを添加し、抽出前のスピンステップを追加することで、これらの汚染物質の多くを最小限に抑えます。
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困難なサンプルに適しています(針葉樹の組織&種子) | 高速かつ取り扱いが容易 | マイクロRNA & small RNAを効率的に回収 | 高速&完全自動化 | |
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植物RNA用の試薬 | PureLink RNA Miniキット | mirVana miRNA Isolation Kit | MagMAX-96 Total RNA Isolation Kit | |
Top seller | ✓ | |||
単離されたRNAタイプ | 大きなRNA分子のみ | 大きなRNA分子のみ | 小さい&大きいRNA分子 | 大きなRNA分子のみ |
調製時間 | 60分 | <20分 | 30分 | <45分 |
開始物質の量 | 最大1 g | <250 mg | 0.5~250 mg | 最大10 mg |
分離方法 | 高純度有機抽出(アルコール沈殿が必要) | 迅速簡便なシリカカラム | 最高の純度&と利便性。有機抽出&とシリカカラムの両方を含みます(沈殿不要)。 | 大容量化可能でフレキシブルな磁気ビーズ法 |
ハイスループット対応 | ✓ |
培養細胞や組織サンプルとは異なり、血液サンプルからRNAを抽出するには、血液細胞からRNAを放出させるために、細胞の分離と溶解のための追加ステップが必要になります。さらに、血液サンプルには赤血球、血小板、白血球のさまざまなサブセットなど、さまざまな種類の細胞が含まれている場合があり、RNA組成にばらつきが生じる可能性があります。そのため、RNA抽出を確実に成功させるには、特定の血液サンプルと適切なプロトコルを慎重に検討する必要があります。
血液サンプルからのRNA抽出には、いくつかの重要なステップが含まれます。まず、血液サンプルを採取して処理し、白血球を含む細胞分画を血漿または血清から分離します。その後、細胞分画を溶解してRNAを放出し、ライセートを試薬で処理し、RNAを安定化させ分解から保護します。RNA抽出キットは、カラムベースの精製やフェノールクロロホルム抽出などの方法を利用して、血液細胞からRNAを分離します。
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特長 | Optimized for liquid samples | 専用キットによる非核赤血球の除去 | HTPニーズに対応する、96カラムのフィルタープレートフォーマット | HTPは安定化した血液サンプルからの精製に最適化されています | HTPフォーマットで、あらゆるサイズのRNA(microRNAを含む)を回収できます | 全血から直接RNA収量が高いため、白血球を単離する必要はありません |
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TRIzol LS | PureLink Total RNA Blood Kit | PureLink Pro 96トータルRNA精製キット | 安定化した血液チューブRNA単離キット用MagMAX | MagMAX mirVana Total RNA Isolation | RiboPure Blood Kit | |
Top seller | ✓ | |||||
適合する安定化試薬 | EDTA、ヘパリン、クエン酸塩、RNAlater | EDTA、ヘパリン、クエン酸塩 | EDTA、ヘパリン、クエン酸塩 | TempusまたはPaxGeneチューブ | EDTAまたはクエン酸塩 | EDTA、ヘパリン、クエン酸塩、RNAlater |
安定化試薬が付属 | ✓ RNAlater | |||||
分離方法 | 高純度有機抽出(アルコール沈殿が必要) | 迅速簡便なシリカカラム | プレートフォーマットの高速で便利なシリカカラム | 大容量化可能でフレキシブルな磁気ビーズ法 | 大容量化可能でフレキシブルな磁気ビーズ法 | 最高純度の&利便性有機抽出&シリカカラムの両方を含有(沈殿不要) |
調製時間 | 1時間 | 20分 | 10-40分 | 2時間でチューブ12本 | 96 samples in <1 hr | 30分 |
ハイスループット対応 | ✓ | ✓ | ✓ |
Tempus Blood RNA Tubesは、ダウンストリームアッセイで使用できるトータルRNAを、全血の収集時点で安定化および精製するのに使用できます。各Tempusチューブは安定化および溶解試薬を含んでおり、その後の赤血球溶解やプロテイナーゼK処理を不要にします。RNA安定化試薬はRNaseを不活性化し、RNAを選択的に沈降させます。RNAがペレット化されると、Tempusチューブに保存された血液サンプルの上清からゲノムDNAを分離することもできます。
培養細胞や組織サンプルとは異なり、酵母サンプルからのRNA抽出は、植物細胞の細胞壁や動物組織の細胞-細胞結合などの複雑な細胞構造がないため、比較的簡単です。さらに、酵母サンプルは通常均一な細胞集団を含むため、抽出プロセスを簡素化し、RNA組成のばらつきを低減できます。
酵母サンプルからRNAを抽出する方法は、3つの簡単なステップで構成されます。1)酵母細胞を回収し、溶解し、酵素消化または機械的破壊によりRNAを放出する。2)ライセートを抽出試薬で処理して細胞成分を可溶化し、RNAを分解から保護する。3)カラムベースの精製またはフェノールクロロホルム抽出でRNAを抽出する。
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高速&完全自動化 | 高速かつ取り扱いが容易 | 発現プロファイルを維持しながら、硬質な酵母細胞壁用に設計されています | 迅速で便利なカラムベース、96サンプル用フィルタープレートフォーマット(RNA >20 0nt) | |
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マイクロアレイ用Platinum Taq MagMAXトータルRNA単離キット | PureLink RNA Miniキット | RiboPure酵母キット | PureLink Pro 96トータルRNA精製キット | |
Top seller | ✓ | |||
細胞溶解用の特殊ビーズが付属しています | 無し | 無し | ジルコニアビーズ | No |
分離方法 | 有機抽出および磁気ビーズを含み、最高純度を実現するスケーラブルで柔軟なフォーマット | 迅速簡便なシリカカラム | 最高の純度と利便性。有機抽出とシリカカラムの両方を含みます | 96ウェルフィルタープレートフォーマットの高速で便利なシリカカラム |
調製時間 | <1時間 | 20分 | 90分(DNase処理を含む) | 20分 |
開始物質の量 | 最高1x106細胞 | 最高1x108細胞 | 最高3x108細胞 | 1.8 mLの新鮮な対数期の酵母細胞(OD660=0.6~0.8) |
ハイスループット対応 | ✓ | |||
キット容量 | 96回分 | 50回分 | 50回分 | 96回分 |
細菌サンプルからRNAを抽出することは、複雑な細胞構造を持たないため、培養細胞や組織サンプルと比較して比較的簡単です。細菌サンプルには通常、均一な細胞集団が含まれているため、RNA抽出プロセスを簡素化し、ヘルプピンは RNA組成のばらつきを誘引します。さらに、細菌サンプルでは、汚染されたDNAを除去し、純粋なRNAサンプルを得るための酵素処理などの追加のステップが必要になる場合があります。
酵母サンプルでのRNA単離と同様に、細菌サンプルからRNAを抽出する方法には3つの簡単なステップがあります。1)細菌細胞を回収し、溶解し、酵素消化、機械的破壊、または化学的溶解によりRNAを放出します。2)ライセートを抽出試薬で処理することで細胞成分を可溶化し、RNAを分解から保護します。3)カラムベースの精製またはフェノールクロロホルム抽出でRNAを抽出します。
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溶解手順はありません | 迅速&簡便なプロトコル、20分 | 迅速で便利なシリカカラムベースのフィルタープレートフォーマット | HTP対応、45分 | |
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TRIzol Max細菌RNA単離キット | PureLink RNA Miniキット | PureLink Pro 96トータルRNA精製キット | MagMAX Total Nucleic Acid Isolation Kit | |
Top seller | ✓ | |||
細胞溶解用の特殊ビーズが付属しています | 無し | 無し | 無し | ジルコニアビーズ |
分離方法 | 高純度有機抽出(アルコール沈殿が必要) | 迅速簡便なシリカカラム | 96ウェルフィルタープレートフォーマットの高速で便利なシリカカラム | 大容量化可能でフレキシブルな磁気ビーズ法 |
調製時間 | 1時間 | 20分 | 20分 | 45分 |
開始物質の量 | 最高1x108細胞 | 最高1x109細胞 | 最大1x109細胞 | 最大0.3 gの固体サンプルまたは175 µLの液体サンプル |
ハイスループット対応 | ✓ | ✓ | ||
キット容量 | 100回分 | 50回分 | 96回分 | 100回分 |
組織サンプルからRNAを抽出するには、特定の組織からRNA分子を分離および精製します。この方法では組織サンプルを回収する必要があり、生検や外科的処置などのさまざまな手法で入手できます。次に、組織をホモジナイズして、細胞を破壊し、RNAを放出します。抽出されたRNAには、組織内に存在するさまざまな細胞タイプの混合物が含まれている場合があり、RNA組成にばらつきが生じる可能性があります。したがって、組織サンプルのタイプとサイズを慎重に選択し、目的の細胞集団を確実に表すことが重要です。
今すぐ注文 | 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | 今すぐ注文 | |
高純度でインタクトなRNAのゴールドスタンダード | シンプルで信頼性の高い迅速なメソッド | 96サンプル用の高速で便利なカラムベースのフィルタープレートフォーマット(RNA >200 nt) | 限られたサンプル量から迅速で便利なカラムベースのメソッド(RNA >200 nt) | 小型RNA種の迅速で便利な方法 | 最高純度のTRIzol+カラム精製で、沈殿は不要です | HTPフォーマットで、あらゆるサイズのRNA(microRNAを含む)を回収できます | |
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TRIzol Reagent | PureLink RNA Miniキット | PureLink Pro 96トータルRNA精製キット | PureLink RNAマイクロスケールキット | mirVana miRNA Isolation Kit | TRIzol Plus RNA Purification System | MagMAX mirVana Total RNA Isolation | |
Top seller | ✓ | ||||||
分離方法 | 高純度有機抽出(アルコール沈殿が必要) | 迅速簡便なシリカカラム | 迅速フィルタープレートフォーマットの便利なシリカカラム | 迅速で便利なマイクロシリカカラム | 有機抽出と便利なシリカカラムの組み合わせ | 最高の純度と利便性。有機抽出とシリカカラムの両方を含みます(沈殿不要) | 大容量化可能でフレキシブルな磁気ビーズ法 |
調製時間 | 1時間 | 20分 | 20分 | 20分 | 30分 | 1時間 | <1時間 |
開始物質の量 | 最大100 mg | 10 mg~100 mg | 10細胞~10 mg | 最大10 mg | 最大250 mgの組織 | 最大100 mg | 最大50 mg |
ハイスループット対応 | ✓ | ✓ | |||||
調製サイズ | 100回分 | 50回分 | 96回分 | 50回分 | 96回分 | 50回分 | 96回分 |
注:このプロトコルでは、TRIzolまたは同様の試薬を使用した組織からのRNA抽出プロセスの基本的な概要を提供します。詳細なガイドラインと安全上の注意事項については、試薬に付属の具体的な説明書を参照することが重要です。
細胞からのRNA抽出は、培養細胞または細胞懸濁液から特異的にRNAを単離するプロセスです。この方法には、酵素的に細胞膜を分解して、RNAなどの細胞内容物を放出することが含まれます。組織サンプルとは異なり、細胞培養ではより均質な細胞集団が得られるため、その集団内の遺伝子発現をより特異的に分析できます。さらに、細胞培養は制御された条件下で操作および処理できるため、さまざまな実験介入がRNA発現に与える影響を研究しやすくなります。
最初にRNAを単離することなく、培養細胞ライセートを分析することもできます。qPCRの結果は、精製したRNAと同等または場合によってはそれ以上の結果を得ることができます。Cells-to-CTおよびSingle Cell-to-CT製品ラインなどのInvitrogen製品は、優れた性能と取り扱いの利点を提供します。
はい、RNAは細胞から抽出できます。このプロセスは、通常、培養細胞は均一な細胞集団であり、組織はより不均一であり、多くの細胞集団と細胞外マトリックスを含んでいるため、組織サンプルからRNAを抽出すると比較してわずかに異なります。
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高純度で完全なRNA | RNA>(200 nt)用の高速で便利なカラムベースのフォーマット | 96サンプル用の高速で便利なカラムベースのフィルタープレートフォーマット(RNA >200 nt) | 限られたサンプル量から迅速で便利なカラムベースのメソッド(RNA >200 nt) | スモールRNA種の迅速で便利な方法 | RNA精製なしでqRT-PCRへの細胞用の完全なシステム | |
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TRIzol Reagent | PureLink RNA Miniキット | PureLink Pro 96トータルRNA精製キット | PureLink RNAマイクロスケールキット | MirVana miRNA Isolation Kit | Cells-to-CTキット | |
Top seller | ✓ | ✓ | ✓ | ✓ | ||
調製時間 | 1時間 | 20分 | 20分 | 20分 | 30分 | <10分 |
細胞溶解法 | 高純度有機抽出(アルコール沈殿が必要) | 無毒性グアニジンイソチオシアン酸塩の溶解 | 無毒性グアニジンイソチオシアン酸塩の溶解 | 無毒性グアニジンイソチオシアン酸塩の溶解 | 有機抽出の後にアルコール沈殿 | Cells-to-CT溶解 |
開始物質の量 | 最高1x107細胞 | 5x106~1x108細胞 | 5x106~1x108細胞 | 最高1x105細胞 | 102~107培養細胞 | 10~100,000細胞 |
アプリケーション | すべてのRNA発現法 | qRT-PCR、NGS | qRT-PCR、NGS | qRT-PCR、NGS | Micro RNA解析 | qRT-PCR |
ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)サンプルからRNAを抽出することは、分子生物学研究において重要な技術です。FFPEサンプルは貴重なアーカイブ組織標本を提供するため、臨床および病理学的研究で一般的に使用されます。しかし、FFPEサンプルの保存プロセスはRNAの著しい分解やクロスリンクを引き起こす可能性があるため、抽出プロセスを困難にしています。
FFPEサンプルからRNAを抽出する方法には、いくつかの重要なステップがあります。
FFPEサンプル中のRNAの分解やクロスリンクが発生する可能性があるため、抽出されたRNAは最高品質ではない場合があります。そのため、RNAの完全性を慎重に評価し、RT-qPCRやRNAシーケンシングなどの分解RNA用に特別に設計された方法の使用を検討することが不可欠です。
FFPE組織から単離されたRNAの全体的な品質と収量に影響を与える可能性のあるいくつかの要因があります。FFPEサンプルを扱う際の推奨事項をまとめたものです。
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同じFFPE切片からRNAとDNAを低スループットで単離します | 同じFFPE切片からRNAとDNAを拡張可能に単離 | |
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RecoverAll Total Nucleic Acid Isolation Kit for FFPE | MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra Kit | |
調製時間 | 4.5時間(16サンプルの総時間) 操作時間2.5時間 | 4時間(96回分の調製にかかる合計時間) 操作時間1時間 |
Final product extracted | トータルRNA、microRNA、gDNA | トータルRNA、microRNA、gDNA |
分離方法 | カラム精製 | 磁気ビーズ精製 |
脱パラフィンが必要です | ✓ | ✓ |
自動化対応(脱パラフィン後) | ✓ (KingFisher FlexおよびDuo Primeのスクリプト) | |
適合するFFPEサンプル範囲 | 最大4 x 20ミクロンの切片 (300 mm2組織) | 最大2 x 20ミクロンの切片 (300 mm2組織) |
サンプル量 | 約50 µLの精製DNA 約50 µLの精製RNA | 約50 µLの精製DNA 約50 µLの精製RNA |
Ion AmpliSeq DNAパネル(例:Cancer Hotspot Panel v2)と互換性があります | ✓ | ✓ |
Ion AmpliSeq RNAパネル(RNAがんやRNA融合など)と互換性があります | ✓ | ✓ |
植物RNAの抽出には、細胞壁を破壊するための組織のホモジナイゼーション、細胞成分を可溶化するための抽出試薬による処理、汚染物質の除去、抽出RNAの精製など、いくつかの重要なステップが含まれます。植物サンプルからRNAを抽出する方法では、硬質の細胞壁が存在し、二次代謝物が高レベルであるために、特有の課題があります。
植物RNAの単離における大きな問題の1つは、ポリフェノール化合物や多糖類などの生体分子の存在です。Invitrogen Plant RNA Isolation Aidは、ポリフェノールや多糖類と結合する高分子量ポリマーであるポリビニルピロリドンを添加し、抽出前のスピンステップを追加することで、これらの汚染物質の多くを最小限に抑えます。
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困難なサンプルに適しています(針葉樹の組織&種子) | 高速かつ取り扱いが容易 | マイクロRNA & small RNAを効率的に回収 | 高速&完全自動化 | |
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植物RNA用の試薬 | PureLink RNA Miniキット | mirVana miRNA Isolation Kit | MagMAX-96 Total RNA Isolation Kit | |
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単離されたRNAタイプ | 大きなRNA分子のみ | 大きなRNA分子のみ | 小さい&大きいRNA分子 | 大きなRNA分子のみ |
調製時間 | 60分 | <20分 | 30分 | <45分 |
開始物質の量 | 最大1 g | <250 mg | 0.5~250 mg | 最大10 mg |
分離方法 | 高純度有機抽出(アルコール沈殿が必要) | 迅速簡便なシリカカラム | 最高の純度&と利便性。有機抽出&とシリカカラムの両方を含みます(沈殿不要)。 | 大容量化可能でフレキシブルな磁気ビーズ法 |
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培養細胞や組織サンプルとは異なり、血液サンプルからRNAを抽出するには、血液細胞からRNAを放出させるために、細胞の分離と溶解のための追加ステップが必要になります。さらに、血液サンプルには赤血球、血小板、白血球のさまざまなサブセットなど、さまざまな種類の細胞が含まれている場合があり、RNA組成にばらつきが生じる可能性があります。そのため、RNA抽出を確実に成功させるには、特定の血液サンプルと適切なプロトコルを慎重に検討する必要があります。
血液サンプルからのRNA抽出には、いくつかの重要なステップが含まれます。まず、血液サンプルを採取して処理し、白血球を含む細胞分画を血漿または血清から分離します。その後、細胞分画を溶解してRNAを放出し、ライセートを試薬で処理し、RNAを安定化させ分解から保護します。RNA抽出キットは、カラムベースの精製やフェノールクロロホルム抽出などの方法を利用して、血液細胞からRNAを分離します。
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特長 | Optimized for liquid samples | 専用キットによる非核赤血球の除去 | HTPニーズに対応する、96カラムのフィルタープレートフォーマット | HTPは安定化した血液サンプルからの精製に最適化されています | HTPフォーマットで、あらゆるサイズのRNA(microRNAを含む)を回収できます | 全血から直接RNA収量が高いため、白血球を単離する必要はありません |
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TRIzol LS | PureLink Total RNA Blood Kit | PureLink Pro 96トータルRNA精製キット | 安定化した血液チューブRNA単離キット用MagMAX | MagMAX mirVana Total RNA Isolation | RiboPure Blood Kit | |
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適合する安定化試薬 | EDTA、ヘパリン、クエン酸塩、RNAlater | EDTA、ヘパリン、クエン酸塩 | EDTA、ヘパリン、クエン酸塩 | TempusまたはPaxGeneチューブ | EDTAまたはクエン酸塩 | EDTA、ヘパリン、クエン酸塩、RNAlater |
安定化試薬が付属 | ✓ RNAlater | |||||
分離方法 | 高純度有機抽出(アルコール沈殿が必要) | 迅速簡便なシリカカラム | プレートフォーマットの高速で便利なシリカカラム | 大容量化可能でフレキシブルな磁気ビーズ法 | 大容量化可能でフレキシブルな磁気ビーズ法 | 最高純度の&利便性有機抽出&シリカカラムの両方を含有(沈殿不要) |
調製時間 | 1時間 | 20分 | 10-40分 | 2時間でチューブ12本 | 96 samples in <1 hr | 30分 |
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Tempus Blood RNA Tubesは、ダウンストリームアッセイで使用できるトータルRNAを、全血の収集時点で安定化および精製するのに使用できます。各Tempusチューブは安定化および溶解試薬を含んでおり、その後の赤血球溶解やプロテイナーゼK処理を不要にします。RNA安定化試薬はRNaseを不活性化し、RNAを選択的に沈降させます。RNAがペレット化されると、Tempusチューブに保存された血液サンプルの上清からゲノムDNAを分離することもできます。
培養細胞や組織サンプルとは異なり、酵母サンプルからのRNA抽出は、植物細胞の細胞壁や動物組織の細胞-細胞結合などの複雑な細胞構造がないため、比較的簡単です。さらに、酵母サンプルは通常均一な細胞集団を含むため、抽出プロセスを簡素化し、RNA組成のばらつきを低減できます。
酵母サンプルからRNAを抽出する方法は、3つの簡単なステップで構成されます。1)酵母細胞を回収し、溶解し、酵素消化または機械的破壊によりRNAを放出する。2)ライセートを抽出試薬で処理して細胞成分を可溶化し、RNAを分解から保護する。3)カラムベースの精製またはフェノールクロロホルム抽出でRNAを抽出する。
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高速&完全自動化 | 高速かつ取り扱いが容易 | 発現プロファイルを維持しながら、硬質な酵母細胞壁用に設計されています | 迅速で便利なカラムベース、96サンプル用フィルタープレートフォーマット(RNA >20 0nt) | |
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マイクロアレイ用Platinum Taq MagMAXトータルRNA単離キット | PureLink RNA Miniキット | RiboPure酵母キット | PureLink Pro 96トータルRNA精製キット | |
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細胞溶解用の特殊ビーズが付属しています | 無し | 無し | ジルコニアビーズ | No |
分離方法 | 有機抽出および磁気ビーズを含み、最高純度を実現するスケーラブルで柔軟なフォーマット | 迅速簡便なシリカカラム | 最高の純度と利便性。有機抽出とシリカカラムの両方を含みます | 96ウェルフィルタープレートフォーマットの高速で便利なシリカカラム |
調製時間 | <1時間 | 20分 | 90分(DNase処理を含む) | 20分 |
開始物質の量 | 最高1x106細胞 | 最高1x108細胞 | 最高3x108細胞 | 1.8 mLの新鮮な対数期の酵母細胞(OD660=0.6~0.8) |
ハイスループット対応 | ✓ | |||
キット容量 | 96回分 | 50回分 | 50回分 | 96回分 |
細菌サンプルからRNAを抽出することは、複雑な細胞構造を持たないため、培養細胞や組織サンプルと比較して比較的簡単です。細菌サンプルには通常、均一な細胞集団が含まれているため、RNA抽出プロセスを簡素化し、ヘルプピンは RNA組成のばらつきを誘引します。さらに、細菌サンプルでは、汚染されたDNAを除去し、純粋なRNAサンプルを得るための酵素処理などの追加のステップが必要になる場合があります。
酵母サンプルでのRNA単離と同様に、細菌サンプルからRNAを抽出する方法には3つの簡単なステップがあります。1)細菌細胞を回収し、溶解し、酵素消化、機械的破壊、または化学的溶解によりRNAを放出します。2)ライセートを抽出試薬で処理することで細胞成分を可溶化し、RNAを分解から保護します。3)カラムベースの精製またはフェノールクロロホルム抽出でRNAを抽出します。
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溶解手順はありません | 迅速&簡便なプロトコル、20分 | 迅速で便利なシリカカラムベースのフィルタープレートフォーマット | HTP対応、45分 | |
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分離方法 | 高純度有機抽出(アルコール沈殿が必要) | 迅速簡便なシリカカラム | 96ウェルフィルタープレートフォーマットの高速で便利なシリカカラム | 大容量化可能でフレキシブルな磁気ビーズ法 |
調製時間 | 1時間 | 20分 | 20分 | 45分 |
開始物質の量 | 最高1x108細胞 | 最高1x109細胞 | 最大1x109細胞 | 最大0.3 gの固体サンプルまたは175 µLの液体サンプル |
ハイスループット対応 | ✓ | ✓ | ||
キット容量 | 100回分 | 50回分 | 96回分 | 100回分 |
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For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
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